Medresenin kitabesi bugün Ulu Cami’nin son cemaat mahalli güney duvarının dış cephesinde bulunmaktadır. Yazılı kaynaklardan Bayburt Ulu Cami’nin kuzey cephesinde bulunduğunu öğrenmekteyiz Sultan Olcayto zamanında İlhanlı umumi valilerinden Fahreddin Emir Mahmud tarafından, kitabesine göre 1308 yılında inşa edildiği belirtilmektedir.
Bayburt lu Ahi Ahmed ve Ekmeleddin Muhammed el Baberti gibi ünlü bilim adamları medreselerden yetişmiştir. Bu medreseler il merkezinde ulu camii bitişiğinde bulunmaktadır.